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PubChem 是一个由美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)维护的公共化学数据库。该数据库提供了大量小分子生物活性信息,包括化合物的结构、物理化学性质、生物活性数据以及相关文献引证等。PubChem 数据库不仅为科研人员提供了一个广泛查询和获取化学物质信息的平台,还对药物发现、材料科学、毒理学和环境科学等领域的研究产生了重要影响。

数据库结构和内容
PubChem 数据库主要包含以下几个部分:
化合物信息:包括化合物的名称、分子式、分子量、CAS 号等基本信息。此外,还提供了化合物的结构信息,通常以 SMILES 或 MOL 文件格式提供。
物理化学性质:包括化合物的热力学性质(如熔点、沸点)、溶解度、旋光度等。这些信息对于理解化合物的稳定性和反应性非常重要。
生物活性数据:这是 PubChem 数据库的核心部分,提供了化合物对特定生物靶标或生物体的活性数据,包括 IC50 值、EC50 值、抑制率等。这些数据对于药物设计和毒性评估具有重要价值。
文献引证:PubChem 还包含了大量与化合物相关的文献引用,用户可以通过这些引证了解化合物的研究历史和最新进展。
查询和检索
PubChem 提供了多种查询和检索方式,用户可以通过化合物名称、CAS 号、SMILES 或 MOL 文件等多种方式进行检索。此外,数据库还支持高级搜索功能,允许用户组合多个条件进行精确查询。
应用领域
由于 PubChem 数据库的丰富信息和广泛应用,它已经成为多个领域研究人员的重要工具。例如:
- 药物发现:通过查询 PubChem 数据库,研究人员可以快速筛选出具有潜在治疗价值的化合物,并进行进一步的实验验证。
- 材料科学:在材料科学中,PubChem 数据库被用于开发新型高性能材料,如催化剂、电池材料和药物递送系统。
- 毒理学和环境科学:PubChem 数据库中的生物活性数据对于评估新化学品的环境和健康风险至关重要。
- 农业科学:研究人员可以利用 PubChem 数据库中的信息,开发新型农药和肥料,以提高农作物的产量和质量。
数据更新和维护
PubChem 数据库定期进行数据更新和维护,以确保信息的准确性和时效性。数据库中的数据主要来源于学术期刊、会议论文、专利文献和其他公开发布的资源。为了保持数据的完整性和一致性,NCBI 会对入库数据进行严格的审核和验证。
结论
PubChem 数据库作为一个重要的公共化学信息资源,为全球科研人员提供了一个全面、系统的化学物质信息平台。通过充分利用 PubChem 数据库,研究人员可以在药物发现、材料科学、毒理学和环境科学等领域取得更多的突破和创新。随着技术的不断进步和数据资源的日益丰富,PubChem 数据库在未来将继续发挥重要作用,推动相关领域的科学研究和技术发展。